Nunca deberías dudar entre clepsidra y la palabra clepzidra a la hora de escribir, pues solo existe una forma posible de escribir este término de forma correcta, y es: clepsidra. La palabra clepzidra simplemente no corresponde a ninguna palabra que se encuentre en el diccionario de la RAE.
Lo que deberías tener presente es que la confusión a la hora de escribir ‘x’ o ‘s’ suele deberse a que, a pesar de que teóricamente deben pronunciarse de manera diferenciada, un grueso importante de hablantes de español pronuncia la letra ‘x’ como si fueran /s/. A pesar de todo, este modo de pronunciar solamente es correcta cuando la ‘x’ se encuentra al inicio del vocablo o a final de sílaba, y nunca en posición intervocálica, que es cuando hay que evitar el sonido /s/ y pronunciarse como /k+s/ o /g+s/. Habitualmente las dudas en el momento de escribir derivan de una {mala pronunciación|pronunciación desacertada, por tanto, escuchar cómo se pronuncian adecuadamente los términos puede ayudarnos a escribir correctamente y aprender cuándo hay que escribir ‘x’ y cuándo ‘s’.
Debes recordar que la confusión a la hora de escribir las letras ‘x’ o ‘s’ se debe a que, por más que teóricamente deben pronunciarse diferenciándose, la mayor parte de hispanohablantes pronuncia las ‘x’ como si fueran /s/. Con todo, esta manera de pronunciar tan solo se considera correcta cuando la ‘x’ está al inicio del vocablo o a final de sílaba, y jamás en posición intervocálica, que es cuando debe evitarse el sonido /s/ y pronunciarse como /k+s/ o /g+s/. Habitualmente las dudas a la hora de escribir nacen de una {mala pronunciación|pronunciación deficiente, por tanto, escuchar con atención la forma en que se pronuncian adecuadamente las palabras puede contribuir en gran medida para que podamos escribir mejor y recordar cuándo escribir la letra ‘x’ y cuándo la letra ‘s’.
Quisiéramos además, recomendarte un ejercicio muy eficaz para que recuerdes de forma definitiva cómo se escribe de forma correcta la palabra clepsidra, y nunca jamás tengas otra vez dudas entre sí esta palabra se escribe con ‘x’ o con ‘s’. Consiste en construir una oración sencilla con el vocablo clepsidra, incluyendo al final como conclusión ‘con s’ o ‘con x’, dependiendo de si el modo correcto de escribir el vocablo es con la letra ‘s’ o con la letra ‘x’. De esta forma nunca te olvidarás, te lo garantizamos.