No deberías dudar entre separara y el término zeparara cuando quieras escribir, debido a que solamente existe una forma posible de escribir esta palabra de forma correcta, y es: separara. La palabra zeparara simplemente no se encuentra en el diccionario de la RAE.
Hay algo que deberás tener siempre presente, y es que la confusión con las palabras que llevan las letras ‘x’ o ‘s’ se debe a que, aun cuando supuestamente deben pronunciarse de modo diferenciado, una parte importante de hablantes de lengua hispana pronuncia las ‘x’ como si fueran /s/. Con todo, esta manera de pronunciar únicamente está bien cuando la ‘x’ está al inicio de la palabra o finalizando una sílaba, y jamás en posición intervocálica, que es cuando se tiene que evitar la pronunciación /s/ y se debe pronunciar como /k+s/ o /g+s/. Con frecuencia las dudas a la hora de escribir derivan de una {mala pronunciación|pronunciación equivocada, por lo cual prestar atención el modo en que se pronuncian adecuadamente los vocablos puede contribuir en gran medida para que podamos escribir de un modo más correcto y aprender cuándo se tiene que escribir la letra ‘x’ y cuándo ‘s’.
Debes recordar que la confusión cuando debemos escribir las letras ‘x’ o ‘s’ se debe a que, por más que supuestamente tienen que pronunciarse diferenciándose, una parte importante de hablantes de español pronuncia la letra ‘x’ como si fueran /s/. Con todo, esta pronunciación únicamente es correcta cuando la ‘x’ está al principio del vocablo o finalizando una sílaba, y en ningún caso entre dos vocales, que es cuando tenemos que evitar el sonido /s/ y se debe pronunciar como /k+s/ o /g+s/. Frecuentemente las dudas acerca de cuándo escribir ‘s’ o ‘x’ resultan de una {mala pronunciación|pronunciación errónea, por ese motivo, prestar atención la manera en que se pronuncian adecuadamente las palabras puede servir de ayuda para escribir mejor y recordar cuándo se tiene que escribir ‘x’ y cuándo la letra ‘s’.
Quisiéramos además, recomendarte un ejercicio muy conveniente para memorizar y recordar de un modo definitivo cómo se escribe de la manera correcta la palabra separara, y nunca jamás vuelvas a sentir la incertidumbre entre sí esta palabra se debe escribir con ‘x’ o con ‘s’. El consejo se basa en elaborar una oración sencilla con la palabra separara, incluyendo al final de la misma ‘con s’ o ‘con x’, dependiendo de si el modo correcto de escribir el término es con o con la letra ‘x’. De esta manera lo recordarás siempre, puedes darlo por seguro.