Jamás debes dudar entre el término separaron y la palabra xepararon cuando te veas en la necesidad de escribir, dado que solo nos encontramos con una forma viable de escribir esta palabra correctamente, y es: separaron. La palabra xepararon simplemente no aparece en el diccionario de la RAE.
Recuerda que la confusión con las palabras que llevan las letras ‘x’ o ‘s’ suele deberse a que, pese a que teóricamente tienen que pronunciarse diferenciándose, un grueso importante de hispanohablantes pronuncia la letra ‘x’ como si fuesen /s/. Pese a todo, esta manera de pronunciar únicamente está aceptada por la RAE cuando la ‘x’ se encuentra al inicio del vocablo o a final de sílaba, y nunca en posición intervocálica, que es cuando tenemos que evitar la pronunciación /s/ y se debe pronunciar como /k+s/ o /g+s/. Habitualmente las dudas a la hora de escribir derivan de una {mala pronunciación|pronunciación equivocada, por lo cual escuchar con atención la manera en que se pronuncian adecuadamente las palabras puede contribuir para que podamos escribir cada vez mejor y aprender cuándo se tiene que escribir ‘x’ y cuándo la letra ‘s’.
Lo que deberías tener presente es que el error a la hora de escribir ‘x’ o ‘s’ suele deberse a que, pese a que teóricamente tienen que pronunciarse de forma que se puedan distinguir, una parte importante de hablantes de español pronuncia las ‘x’ como si fuesen /s/. A pesar de todo, esta pronunciación solamente está aceptada por la RAE cuando la ‘x’ está al principio de la palabra o a final de sílaba, y nunca jamás entre dos vocales, que es cuando se tiene que evitar la pronunciación /s/ y se debe pronunciar como /k+s/ o /g+s/. A menudo las dudas a la hora de escribir derivan de una {mala pronunciación|pronunciación equivocada, es por eso que escuchar atentamente cómo se pronuncian apropiadamente los términos puede ayudarnos a escribir de un modo adecuado y aprender cuándo escribir la letra ‘x’ y cuándo ‘s’.
Igualmente quisiéramos, proponerte una práctica muy útil para que memorices y recordar siempre cómo escribir de la manera correcta la palabra separaron, y nunca más regresen a ti las dudas entre sí esta palabra se escribe con ‘x’ o con ‘s’. Se trata de formar una oración sencilla con el vocablo separaron, que incluya al final de la misma ‘con s’ o ‘con x’, dependiendo de si la forma correcta de escribir la palabra es con ‘s’ o con ‘x’. De esta manera siempre te acordarás, es un truco infalible.