Nunca jamás deberías dudar entre la palabra significaba y el término zignificaba cuando te veas en la necesidad de escribir, dado que solo existe una manera viable de escribir esta palabra como es debido, y es: significaba. La palabra zignificaba simplemente no aparece en el diccionario de la RAE.
Algo a tener en cuenta es que el error con las palabras que llevan las letras ‘x’ o ‘s’ suele deberse a que, a pesar de que supuestamente deben pronunciarse de forma diferenciada, una parte importante de hablantes de lengua hispana pronuncia las ‘x’ como si fuesen /s/. A pesar de todo, esta forma de pronunciar tan solo está aceptada por la RAE cuando la ‘x’ se encuentra al inicio del vocablo o finalizando una sílaba, y nunca en posición intervocálica, que es cuando debe evitarse la pronunciación /s/ y debe ser pronunciada como /k+s/ o /g+s/. Usualmente las dudas en el momento de escribir derivan de una {mala pronunciación|pronunciación deficiente, por lo que escuchar la manera en que se pronuncian adecuadamente las palabras puede servir de ayuda para escribir de forma correcta y ser capaces de saber cuándo hay que escribir la letra ‘x’ y cuándo la letra ‘s’.
Debes recordar que el error con las palabras que llevan ‘x’ o ‘s’ suele deberse a que, por más que en teoría se tienen que pronunciarse de manera diferenciada, un grueso importante de hispanohablantes pronuncia las ‘x’ como si fuesen /s/. No obstante, esta manera de pronunciar únicamente está aceptada por la RAE cuando la ‘x’ está al principio de la palabra o finalizando una sílaba, y en ningún caso entre dos vocales, que es cuando hay que evitar la pronunciación /s/ y debe ser pronunciada como /k+s/ o /g+s/. A menudo las dudas acerca de cuándo escribir ‘s’ o ‘x’ nacen de una {mala pronunciación|pronunciación deficiente, por lo cual escuchar con atención cómo se pronuncian adecuadamente las palabras nos puede ayudar a escribir cada vez mejor y recordar cuándo se tiene que escribir ‘x’ y cuándo ‘s’.
Así mismo quisiéramos, recomendarte un ejercicio muy útil para memorizar y recordar siempre cómo se escribe de la manera correcta la palabra significaba, y nunca más vuelvas a dudar entre sí esta palabra se debe escribir con ‘x’ o con ‘s’. El truco radica en construir una frase simple con la palabra significaba, que incluya al final como conclusión ‘con s’ o ‘con x’, dependiendo de si el modo correcto de escribir la palabra es con ‘s’ o con la letra ‘x’. De este modo no te olvidarás nunca, te aseguramos que es infalible.